La infección por B. bronchiseptica se diagnostica mejor con muestras de hisopos oro-faríngeos o con muestras de secreción nasal. Las muestras deberían obtenerse con hisopos de algodón estérilizados y colocados en un medio de transporte de carbón antes de colocarse sobre un medio selectivo como agar Bordet-Gengou (BG). B.bronchiseptica se desarrolla con rapidez, con colonias evidentes en agar BG bajo microscopio de disección en el plazo de 48 horas. Las colonias formadas están en la región de 1 mm de diámetro y desarrollan una superficie rugosa con aspecto de metal golpeado. En agar sangre, B.bronchiseptica forma colonias de mayor tamaño que en agar BG, y las colonias son de un color blanco grisáceo, un tanto mate y carentes de la apariencia metálica que tienen en agar BG. B. bronchiseptica puede producir zonas no muy claras de hemólisis en agar BG. 
Figura 1: Bordetella bronchiseptica crecimiento sobre BG |